Коллекцияға минералдар, кен үлгілері, боксит, өсімдіктер мен тірі ағзаның қураған қалдықтары, жануарлар мен құстар тұлыптары кіреді. Лисаков Жоғарғы Тобыл тарихы мен мәдениеті мұражайының жаратылыстану- ғылыми коллекциясына барлығы 800-ден астам сақтау бірлігі бар.